近日,bat365中文官方网站郭文忠教授的博士生戴远飞为第一作者的学术论文被生物信息学领域顶级期刊Briefings in Bioinformatics(中科院1区期刊,影响因子8.990)正式录用。
该论文由戴远飞博士生,在郭文忠教授、布朗大学Carsten Eickhoff教授的联合指导下完成。该论文通过引入基于Wasserstein距离和Gumbel-Softmax松弛的对抗性自动编码器(AAE)实现了一种新的知识图嵌入框架,以完成药物之间相互作用的预测任务。在该框架中,自动编码器用于生成高质量的负样本。判别器正负样本学习药物的嵌入向量和相互作用。 同时,为了解决生成式对抗网络在离散数据上的梯度消失问题,利用Gumbel-Softmax松弛和Wasserstein距离来稳定地训练嵌入模型。
论文录用信息:
Yuanfei Dai, Chenhao Guo, Wenzhong Guo, and Carsten
Eickhoff. Drug-Drug Interaction Prediction with Wasserstein Adversarial
Autoencoder-based Knowledge Graph Embeddings, Accepted by Briefings in
Bioinformatics, 2020.
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